X
Код презентации скопируйте его
12 дуплетный код
Скачать эту презентацию
Презентация на тему 12 дуплетный код
Скачать эту презентациюCлайд 1
12 ДУПЛЕТНЫЙ КОД Турнир юных биологов 2007
Cлайд 2
Генетический код – это Способ записи информации о первичной структуре белков через последовательность нуклеотидов ДНК и РНК = «Словарь» перевода с языка нуклеиновых кислот на язык белков.
Cлайд 3
Каким должен быть дуплетный код Число возможных дуплетов = 16 Им можно закодировать не более 15 а.к. один из дуплетов – на СТОП-кодон
Cлайд 4
Наш метод создания кода: Выбрали белки лизоцим (129 а.к.) и миоглобин (154 а.к.); Разделили а.к. на две группы: а) обязательно кодируемые б) с похожими радикалами Посмотрели, какие а.к. наиболее часто встречаются в данных белках; Подобрали дуплеты и а.к. так, чтобы коэффициент q был как можно больше.
Cлайд 5
Проблема глицина: считать глицин полярной или неполярной а.к.? Мы считали неполярной, потому что: Gly – п: qтр=1,16 Gly – н/п: qтр=1,28
Cлайд 6
Cлайд 7
Знаком начала гена мы выбрали СТАРТ-кодон АУ кодирует Мет, а в начале гена фМет. (в триплетном АУГ) Знак окончания гена – СТОП-кодон УА (в триплетном УАА, УАГ, УГА)
Cлайд 8
Идеальный дуплетный код
Cлайд 9
Свойства дуплетного кода: Отсутствие межкодонных знаков препинания Наличие межгенных знаков препинания Однозначность Неперекрываемость Дуплетность Нет вырожденности (избыточности) Экономичность (на белок той же длины нужно меньше ДНК)
Cлайд 10
Сравним эти два кода – построенный нами дуплетный и стандартный триплетный Один из самых важных параметров - помехоустойчивость
Cлайд 11
Помехоустойчивость X Y 1 2 Консервативная замена – не меняет класс аминокислоты Радикальная замена – меняет класс аминокислоты
Cлайд 12
Гидрофобные (неполярные) Классификация аминокислот по полярности радикала Гидрофильные Полярные Заряженные (ионы) + ─
Cлайд 13
Подсчёт коэффициента помехоустойчивости (q). Число радикальных замен = 40, А консервативных - 44, Учитывая, что глицин – неполярная аминокислота и не включая кодон УА q = 44/40 = 1,1.
Cлайд 14
Недостатки дуплетного кода: Таким кодом невозможно закодировать больше, чем 15 аминокислот. Возможный путь преодоления: Посттрансляционная модификация
Cлайд 15
Molecular Cell Biology Harvey Lodish et al. Примеры пострансляционной модификации аминокислот
Cлайд 16
Недостатки дуплетного кода: Коэффициент помехоустойчивости (q) меньше, чем у триплетного кода (qтр~1,28, а qдп 1,1) Нет вырожденности (избыточности).
Cлайд 17
Литература В.А. Ратнер. Молекулярно-генетические системы управления. Наука, Новосибирск, 1981.
